El club ganó el título por última vez en 2006, venciendo al Real Zaragoza 4-1 para ganar la Copa de España. El equipo también llegó a dos finales en la máxima competición de clubes de Europa, pero perdió ambas, incluida una épica final contra el Bayer Leverkusen que se fue a la prórroga y luego a los penaltis. En 1988 el Barça se fue con las manos vacías, perdiendo 3-2 después de liderar por 3 goles, y en 2007 el año terminó con una desafortunada derrota ante el Sevilla CF en casa, pero logró terminar segundo, lo que fue importante por la excelente Rendimiento europeo esta temporada.